吉備津彦神社の夏祭りである「御田植祭」は、地域の繁栄と五穀豊穣を祈り、自然災害を鎮める為の当社独自の特殊神事として古くから行われてきた祭事です。

８月２日は、茅の輪をくぐり心身を清める「厄神祭」、地域の繁栄と五穀豊穣を祈って田舞を奉納する「本殿祭」、風水害を鎮め、豊作と万民の平穏を祈願する密祭として「御斗代神事」が斎行されます。

また、翌３日は「本殿祭」「御幡献納神事」が斎行されます。この神事は、当神社の紙本淡彩神事絵巻（県指定重要文化財）に図解されており、稲作文化の伝来や吉備津彦命が温羅命を制圧した際の凱旋水軍の様子を表しているともいわれています。行列は、祓主（神職）・太鼓獅子・鼻高面・稲苗・鍬・神職・御幡・氏子等と長蛇の列となり、田歌を歌いながら十数本の御幡の行列が神池を一周します。

御幡の白布は帆船の帆を表し、先端の白うちわや各御幡についている扇は風の神を表しており、風や水の災禍を防ぐよう祈願しています。神事が終了すると、御幡についている扇を授与して持ち帰り、田にたてると豊作になる、といわれています。